柏威夏古寺位于柬埔寨柏威夏省与泰国接壤的边境地区，柏威夏寺的历史悠久。古寺最早的历史可追溯到公元9世纪，它是高棉帝国的君主下令建造的。建于公元10世纪中叶至12世纪初。它矗立在550米高的峭壁上，俯瞰整个柬埔寨平原。由于地处偏远，地形险要，柏威夏寺保存得相当完好。
早在1796年，泰国统治者趁乱占领了柏威夏周围地区，1806年安赞二世（Ang Chan II）夺回该地区。从那时起泰国一直伺机将柏威夏据为己有。1907年柬埔寨成为法国殖民地，泰国同年宣布将柏威夏地区永久性归还。法国于1907年与泰国进行边界勘定,边界地图由法国军官于1908年秋完成，并于1908年送交给暹罗政府。其中有一幅地图将柏威夏寺标绘在边界线的柬埔寨一侧境内。
20世纪50年代，柬埔寨独立后，与泰国就柏威夏寺归属产生争议。泰国于1949-1952年占领该寺。于是刚独立的柬埔寨提出抗议并提交海牙国际法制审理.1962年6月15日,国际法庭判古寺归柬所有,法院认为，地图是作为联合勘界的成果被送交暹罗政府的。当时及以后许多年，暹罗方面许多官员包括前联合勘界委员会的成员都看到过这幅地图，非但没有表示任何不同的意见，并且还对制作地图的法国官员表示感谢。据此，可以认为地图已被暹罗当局所确认。法院因此拒绝泰国方面主张柏威夏寺主权的理由。最后，法院以9票对3票确认柏威夏寺位于柬埔寨主权管辖的领土上，因此判决泰国有义务从柏威夏寺及其邻近的柬埔寨领土上撤出其武装和警察部队及其他警卫和管理人员。虽然有海牙国际法庭的判决，泰国一直没有放弃拥有该地区的任何机会。此后柬埔寨国内动荡，自顾不暇，泰国人致力于从柬埔寨用各种手段搜罗所有和圣寺有关的石刻和文物。
2008年，世界文化遗产委员会通过决议，批准将柏威夏寺列为世界文化遗产。不过柬埔寨的申遗工作，在柬泰两国间引发一系列争议。
