1801年9月9日,萨拉托夫省析置奔萨省。奥洛涅茨州升格奥洛涅茨省。立陶宛省分为维尔纳省(维尔纳州升格)和格罗德诺省(格罗德诺州升格)。沃罗涅日省析置巴甫洛夫省,不久废除。
1802年1月,小俄罗斯省分为切尔尼戈夫省,波尔塔瓦省。3月,白俄罗斯省分为维捷布斯克(Витебскую)省(维捷布斯克州升格)、莫吉廖夫省。奥伦堡省驻地迁至乌法。10月8日,新俄罗斯省分为尼古拉耶夫省、叶卡捷琳诺斯拉夫省、塔夫里奇省。维堡省改为(芬兰语的)维堡省。
1803年5月15日,尼古拉耶夫省驻地迁至赫尔松,改为赫尔松省。阿斯特拉罕省析置高加索省(驻格奥尔基耶夫斯克)。成立堪察加州。
1804年2月,废除科雷万省。托博尔斯克省析置托木斯克州。伊贾斯拉夫省驻地迁至沃伦斯基,改为沃利尼亚省。
1805年,伊尔库茨克州析置雅库特州(雅库茨克)。
1807年6月9日,法国与俄国在东普鲁士签订《提尔西特和约》,默许俄国入侵瑞典王国的芬兰。法国与普鲁士签订的《提尔西特和约》,成立华沙大公国。华沙公国是普鲁士在1806年10月的耶拿会战战败之后被迫割让土地之一。
1808年,占领波兰部分地区成立比亚韦斯托克省。芬兰正式成为俄罗斯帝国的附属国,亚历山大一世建立芬兰大公国。
1809年9月17日,瑞典的屈门卡尔塔诺省、图尔库-波里省、新地-塔瓦斯科胡斯省(Tavastehus,海梅省Hameen)、于列堡省(奥卢省)、瓦萨省、萨沃-卡累利阿省划归沙俄,成立芬兰大公国,首府从图尔库迁至赫尔辛基。图尔库-波里省改为奥布-贝里讷堡省。瓦萨省改为尼古拉斯塔特省。
1810年,占领波兰部分地区成立塔尔诺波尔省。高加索省析置伊梅雷蒂省。
1812年1月4日,(芬兰语的)维堡省划入芬兰大公国,改为维堡省。5月28日,第七次俄土战争结束,签订《布加勒斯特和约》,割让普鲁特河与德涅斯特河之间的领土,成立比萨拉比亚省(首府基什尼奥夫)。
1815年,维也纳会议,华沙大公国由俄奥普三国瓜分。6月9日,俄属波兰成立波兰会议王国。塔尔诺波尔省割让给奥地利。
1816年1月16日,波兰会议王国行政区划经过重组,辖奥古斯图夫省(首府苏瓦乌基)、卡利什省(首府卡利什)、克拉科夫省(首府梅胡夫,后迁至凯尔采,不包括克拉科夫市)、克拉科夫自由市、卢布林省(首府卢布林)、马佐夫舍省(首府华沙)、普沃茨克省(首府普沃茨克)、波德拉谢省(首府谢德尔采,比亚韦斯托克省改名)、桑多梅日省(首府拉多姆)。
1822年1月,《西伯利亚管辖条例》,西伯利亚总督辖区分为西西伯利亚总督辖区(首府鄂木斯克)、东西伯利亚总督辖区(首府伊尔库茨克)。西西伯利亚总督辖区:托博尔斯克省、托木斯克州、鄂木斯克州。东西伯利亚总督辖区:叶尼塞省、伊尔库茨克省(撤销伊尔库茨克州、海滨-鄂霍次克州、雅库特州、堪察加州)。叶尼塞州升格为叶尼塞省。8月10日,高加索省改为高加索边疆区(高加索州,驻斯塔夫罗波尔)。
1829年9月,第八次俄土战争结束,签订《亚得里亚堡和约》,土耳其向俄国割让外高加索沿海的领土,即新罗西斯克。
1830年,成立贾罗-贝多坎州。
1831年,屈门卡尔塔诺省改为圣米凯利省,萨沃-卡累利阿省改为库奥皮奥省,新地-塔瓦斯科胡斯省分为新地省、塔瓦斯科胡斯省。
1834年,基辅省、波多利亚省、沃利尼亚省组成基辅总督区(西南边疆区,又称基辅、波多利亚、沃利尼亚总督区),驻基辅。维尔纳省西部七个区析置科夫诺省。明斯克省属维尔纳总督区管辖。
1835年,自由乌克兰省改为哈尔科夫省。
1837年3月7日,波兰会议王国区划调整,克拉科夫自由市并入克拉科夫省。立陶宛的苏瓦乌基(Suvalkija)划入奥古斯托夫省。
1837年,波兰会议王国成立卡利什省。
1838年,废除鄂木斯克州,并入托博尔斯克省、托木斯克州。
1840年,高加索省析置格鲁吉亚-伊梅雷蒂州(蒂弗利斯、第比利斯)、里海州。
1842年,立陶宛-维尔纳省析置科文斯卡亚(Ковенская)省。
1841年,立陶宛-维尔纳省改为维尔纳省,立陶宛-格罗德诺省改为格罗德诺省。
1842年,波兰的克拉科夫省析置凯尔采省。贾罗-贝多坎州改为贝多坎区。
1844年,波兰会议王国区划调整,辖奥古斯图夫省(首府苏瓦乌基)、卢布林省(首府卢布林)、华沙省(首府华沙)、普沃茨克省(首府普沃茨克)、拉多姆省(首府拉多姆)。波德拉谢省、马佐夫舍省、卡利什省合并为华沙省。克拉科夫省、凯尔采省、桑多梅日省合并为拉多姆省。伊利苏苏丹国、贝多坎区合并为贾罗-贝多坎区,由伊丽莎白堡省管辖。恢复高加索总督区,辖格鲁吉亚-伊梅雷蒂州、里海州、高加索州。
1846年12月14日,撤销格鲁吉亚-伊梅雷蒂州。12月26日,里海州分为沙马基省、杰尔宾特省。
1847年5月2日,高加索边疆区(高加索州)改为斯塔夫罗波尔省,高加索总督区辖库塔伊西省、第比利斯省、沙马基省。杰尔宾特省、塔尔奇沙姆国、梅赫图里汗国组成里海边疆区。
1848年,伊丽莎白堡省析置第比利斯省。
1849年6月,亚美尼亚州改为埃里温省。伊尔库茨克省析置堪察加州。
1851年1月1日,奥伦堡省析置萨马拉省。伊尔库茨克省析置外贝加尔省。成立新普里莫尔斯克州,属东西伯利亚总督区。
1852年,明斯克省脱离维尔纳总督区。
1854年,突厥斯坦总督区成立外里海州。成立西伯利亚吉尔吉斯州、塞米巴拉金斯克州。
1856年,3月30日,第九次俄土战争结束,签订《巴黎和约》,规定将比萨拉比亚南部的博尔格拉德、卡胡儿和伊斯马伊尔三县归还摩尔多瓦。俄军退出克里米亚半岛。11月14日,成立滨海州,驻尼古拉耶夫斯克(庙街)。堪察加州并入滨海州。
1857年,麦格列里斯王国灭亡,成立库塔伊西省。
1858年,滨海州析置阿穆尔州。
1859年,贾罗-贝多坎区改为扎卡塔雷区,改属第比利斯省,伊丽莎白堡省并入第比利斯省。沙马基省地震,迁至巴库,改为巴库省。小玉兹成立奥伦堡-吉尔吉斯州。
1860年4月5日,撤销杰尔宾特省,南部并入巴库省,北部和第比利斯省一部分成立达吉斯坦省。撤销里海边疆区。11月,成立库班州、捷列克州(特尔斯克)。
1862年,明斯克省、维捷布斯克省、莫吉廖夫省属维尔纳总督区管辖。
1863年,奥古斯托省分成苏瓦基省(立陶宛)和沃姆扎省(波兰)。
1864年,割占奥斯曼苏呼米地区,成立苏呼米军区,属库塔伊西省。
1865年,一月起义爆发,遭到镇压,波兰会议王国剩余的独立地位遭到完全废除。波兰会议王国改为维斯瓦河地区总督区。5月5日,奥伦堡省析置乌法省。7月11日,西西伯利亚总督区析置突厥斯坦总督区。
1867年3月30日,美俄双方达成协议,以7,200,000美元成交,将阿拉斯加卖给美国,合约生效日期在1867年10月18日。华沙省析置卡利什省,华沙省和拉多姆省析置彼得库夫省,华沙省和卢布林省析置谢德尔采省,普沃茨克省和奥古斯图夫省析置沃姆扎省,奥古斯图夫省改为苏瓦乌基省,拉多姆省析置凯尔采省。7月,突厥斯坦总督区成立七河州(塞米雷琴斯克)、锡尔河州。
1868年,西伯利亚吉尔吉斯州改为阿克莫林斯克州。巴库省西部、第比利斯省东部析置伊丽莎白堡省。3月,浩罕汗国与俄罗斯签订保护条约,成为俄罗斯帝国附庸。10月21日,奥伦堡省、西西伯利亚省析置乌拉尔斯克州、图尔盖州、塞米巴拉金斯克州。废除科坎德汗国,成立泽拉夫尚军区。
1869年,维捷布斯克省、莫吉廖夫省脱离维尔纳总督区管辖。
1870年,顿河军管领改为顿河军管州。明斯克省脱离维尔纳总督区。
1873年3月20日,俄国国务委员会,圣彼得堡省析置圣彼得堡直辖市。
1875年,维斯瓦河总督区改为维斯瓦河省。
1876年2月19日,浩罕汗国灭亡,成立费尔干纳州。
1878年3月3日,沙皇俄国于对土战争胜利后,迫使奥斯曼帝国签订《圣斯特凡诺条约》,强行规定将比萨拉比亚南部三县划给俄国。从奥斯曼帝国手上夺取领土成立巴统州、卡尔斯州。
1880年,滨海州驻地由庙街迁至伯力。
1881年8月12日,圣彼得堡直辖市并入圣彼得堡省。波尔塔瓦省、切尔尼戈夫省由西南边疆区管辖。
1882年,撤销西西伯利亚总督区,成立草原总督区,辖外里海州、七河州、锡尔河州、阿克莫林斯克州、图尔盖州。突厥斯坦总督区的七河州改属草原总督区。
1883年6月2日,圣彼得堡省析置圣彼得堡直辖市。苏呼米军区改为苏呼米区,属高加索总督直接管辖。巴统州并入库塔伊西省。
1884年,外贝加尔省受滨海总督区管辖。库页岛属阿穆尔总督直辖。6月6日,东西伯利亚总督区分为阿穆尔总督区(驻哈巴罗夫斯克)和伊尔库茨克总督区。阿穆尔总督区辖阿穆尔州、外贝加尔州(外贝加尔省改名)、滨海州。
1887年1月1日,泽拉夫尚军区改为撒马尔罕州。
1888年,滨海州驻地由伯力迁至海参崴。
1896年,库班州析置黑海省(驻新罗西斯克)。
1898年3月27日,沙俄强迫清政府在北京签订《旅大租地条约》,租借大连湾与旅顺口。
1899年,外里海州划属突厥斯坦总督区。8月11日,沙俄颁布《暂行关东州统治规则》,将青泥洼定位为自由港,改为俄财政部直辖的达里尼特别市。