那曲除了西北内流区和属于迫隆藏布江支流易贡藏布江流域的嘉黎县外，大部分人口属于怒江上游河谷，昌都西部也是属于怒江流域，从安多向东沿怒江河谷北侧支流中还有聂荣、索县、巴青、丁青等县，从那曲（色尼区）向东，在怒江右岸比如、边坝、洛隆、八宿、左贡等县，其中丁青、边坝、洛隆、八宿、左贡等是昌都属于怒江流域的西五县，丁青、巴青、索县、比如、嘉黎是藏区历史上有名的霍尔39族地区，边坝以下洛隆、八宿、左贡等县进入怒江峡谷地带，左贡县城位于怒江最大的支流玉曲河谷，玉曲源于类乌齐南部。类乌齐主要属于澜沧江支流，澜沧江支流在昌都汇合向下流经察雅、芒康县西部。澜沧江以东与金沙江的分水岭地带有江达、妥坝、芒康。
