近代昆山县境的变化主要始于民国26年（1937年）。民国26年（1937年）初，昆山县辖8区41乡24镇，区辖乡镇，具体情况如下：
第一区：玉带镇、南濠镇、致和镇、山南镇、学宫镇、北澞乡、乐庵乡、汉坡乡、青墩乡、小澞乡；
第二区：蓬阆镇、夏驾桥镇、包家桥乡、兵晞乡、双林乡、沙葛乡、潘墓乡、腰溇乡；
第三区（自治实验区）：菉葭浜镇、安亭镇、花家桥镇、天福镇、徐公桥乡、泗桥乡、金城乡、西古乡；
第四区：茜墩镇、石浦镇、歇马桥镇、少卿乡、玉溪乡、支浦乡；
第五区：杨湘泾镇、井亭镇、金庄乡、神童乡、白米乡、逸水乡、度城乡、榭麓乡；
第六区：张浦镇、陈墓镇、甪直镇、周巷乡、大慈乡、尚明甸乡、杭上乡、渡头乡、张家厍乡、孟子浜乡；
第七区：正义镇、南星渎镇、绰墩乡、高墟乡、白渔潭乡、式庄乡；
第八区：巴城镇、石牌镇、周墅镇、北六乡、环湖乡、新圩乡、三塘乡、苇舟乡、晚香乡。
民国26年（1937年）11月15日，昆山沦陷，12月，日军成立昆山宣抚班，巴城人周济唐人昆山县维持会会长。昆山县第五区井亭镇、逸水乡划归青浦县。井亭镇就是今天上海市青浦区朱家角镇老镇区的北边部分，逸水乡大致相当于今天昆山市淀山湖南境再向南属于上海市青浦区的淀山湖东岸地方。
民国30年（1941年）1月，青浦县井亭镇、逸水乡重新划归昆山县，青浦县西北部赵屯桥地域划归昆山县。
民国31年（1942年）底，安亭镇属于嘉定县的部分（新亭乡）、嘉定县望仙乡、钱门乡和青浦县启圣乡、金闸乡划归昆山县。
民国32年（1943年）7月，原由青浦县划归昆山县的赵屯桥地域复归青浦县。同年，吴县东境的燕子窠地域划归昆山县。燕子窠地域大致是今天昆山阳澄湖东南岸与高铁之间的地域，就是“渔家灯火”附近。
民国34（1945年）7月，原由嘉定县划归昆山县的新亭乡（安亭镇原属嘉定县部分）、望仙乡、钱门乡复归嘉定县，原由青浦县划归昆山县的启圣乡、金闸乡复归青浦县。8月，日军无条件投降。8月16日，安蔚南任昆山县县长；9月16日，沈霞飞接任昆山县县长。
民国38年（1949年）初，昆山县实行民众组训，设5个督导区分辖1个镇26个乡，具体如下：
第一督导区：巴城乡、三塘乡、周墅乡、金鸡乡、城北乡；
第二督导区：玉山镇、正义乡、南星乡、高墟乡、城南乡；
第三督导区：夏溪乡、菉葭乡、蓬阆乡、花溪乡、安亭乡、茜步乡；
第四督导区：甪直乡、张浦乡、大慈乡、陈墓乡、淀西乡；
第五督导区：杨湘乡、井亭乡、玉溪乡、茜墩乡、石浦乡、淀东乡。
民国38年（1949年）5月13日昆山解放。县委书记空缺，县长刘同温，县委副书记李聚茂、王正。
1950年，昆山县辖10区7镇94乡，具体如下：
正仪区：正仪镇、镇南乡、式庄乡、新南乡、绰墩乡、吴淞乡、黄泥乡、古塘乡、新北乡、星东乡；
巴城区：巴城镇、龙潭乡、杨模乡、关王乡、武城乡、石牌乡、荷花乡、清水乡、雉城乡、杜桥乡；
周墅区：周墅镇、更楼乡、毛竖乡、换新乡、三千乡、朱家乡、腰溇乡、开新乡、新镇乡、太平乡；
茜墩区：茜墩镇、新塘乡、西宿乡、支浦乡、吴桥乡、仲节乡、西河乡、歇马乡、景泾乡、石浦乡、陆桥乡、七千乡；
淀东区：金湖乡、度潭乡、杨湘乡、叶荡乡、双护乡、庙泾乡、小泾乡、永安乡、复兴乡；
张浦区：赵浦乡、安头乡、施条乡、周巷乡、逸泾乡、唐村乡、南港乡、张浦乡、梢里乡、吴家乡；
淀西区：尚明甸乡、张家厍乡、大慈乡、孟子浜乡、虬泽乡、杨树乡、盛塘乡、陈墓乡；
蓬阆区：蓬阆镇、香堂乡、夏桥乡、 唏乡、盛庄乡、茜步乡、沙葛乡、同春乡、双林乡、大通乡、白杨乡、包轿乡；
菉葭区：菉葭镇、菉葭乡、鸡鸣乡、孔巷乡、泗桥乡、花溪乡、金城乡、公桥乡、天福乡、新安乡、陶仁乡；
城郊区：玉山镇、渔东乡、渔西乡、东荡乡、路南乡、路北乡、广福乡、
大渔乡、城北乡。
1951年6月，常熟县石牌乡、巷埭乡划归昆山县巴城区；9月，安亭镇属于昆山县菉葭区的部分划归嘉定县。
1952年9月，吴县陈墓镇、周庄镇、明镜乡、长白乡、浜湖乡、太史乡、双湖乡划归昆山县淀西区，太仓县建设乡所属建中、建南、建立3个村和建北村一部分划归昆山县蓬阆区，甪直镇属于昆山县张浦区的部分划归吴县。
1953年4月，昆山县巴城区巷埭乡第六村第二组划归常熟县。
1954年6月，吴县嘉浦乡西马庄村划归昆山县。西马庄村就是今天昆山市张浦镇南港的西马庄。
1956年9月，昆山县茜墩区叶荡乡（原井亭镇、逸水乡）划归青浦县，青浦县淀西乡、沙田乡、石米乡、港北乡划归昆山县并合并为商塌乡。
1957年7月，昆山县商塌乡划归青浦县。
1958年10月，昆山县辖马鞍山、巴城、石牌、周墅、正仪、菉葭、蓬阆、花桥、茜墩、淀东、张浦、淀西、周庄13个人民公社。昆山县周庄公社张港、池浜、联合、三合4个生产大队划归吴江县屯村公社。
1959年6月，昆山县辖玉山镇1个县属镇及城南、城北、巴城、石牌、周墅、正仪、菉葭、蓬阆、花桥、茜墩、淀东、张浦、淀西、周庄14个人民公社。
至此，昆山县境与今天昆山市的境域相同。
