我觉得至少应该《条例》中至少应该再明确两个内容。
一是行政区划边界争议的解决。比如山东和江苏争议几十年的前三岛问题，到底怎样解决？条例中几乎没有可以援引的依据。就这么拖下去么？各行政区划边界清楚，应该是划分行政区的第一要义吧。
二是现在某些城市要求直辖、某些城市要求单列、某些城市要求县升地，呼声一直都存在，条例中要么就明确不允许存在各种不同的城市级别（这种可能性不大），断了各地的念头；要么就明确城市达到什么规模（人口、建成区面积、经济指标），可以升格为直辖市，什么规模可以计划单列、什么规模可以升格地级市，这样各地都有一个明确的目标，可以为之奋斗。同时考虑到社会总体进步的水平，标准可以十年或二十年一调整，做到有法可依。你在规定时间内达到标准了，那么城市就升格，没有达到标准，那对不起，你继续努力吧。这样一来可以给各地城市以鼓舞和激励，二来也可以让上一级政府有效控制下一级城市的规模，做到均衡发展，避免某地发展失衡。
最后，觉得还是应该设立《行政区划法》为宜，比《条例》的效力要高。
