2000年2月，经芜湖市人民政府批准，芜湖木业经济开发区正式成立，并组建了开发区管委会。是年9月，根据城南新区规划，芜湖市委、市政府将木业经济开发区调整为芜湖经济技术开发区城南高科技园。
2001年2月，芜湖市委、市政府决定成立芜湖高新技术产业开发区(简称“高新区”)，规划面积10平方公里，设立芜湖高新技术产业开发区管委会，马塘区区长任管委会主任。
2006年2月，安徽省人民政府批复芜湖高新技术产业园区为省级开发区（皖政秘2006 22号），面积6.5平方公里，漳河以东、峨山路以南、九华南路以西、纬十路以北。
2010年9月，国务院下发《关于同意芜湖高新技术产业园区升级为国家高新技术产业开发区的批复》（国函2010 101号），芜湖高新技术产业园区升级为国家高新技术产业开发区，定名为芜湖高新技术产业开发区。规划面积由原来的6.5平方千米扩展到32平方千米。12月1日在芜湖科技创新公共服务中心举行揭牌仪式。
2012年？，芜湖高新区与弋江区实行一体化管理。
2015年，根据芜湖市机构编制委员会《关于进一步明确芜湖高新技术产业开发区管理体制及相关问题的批复》(芜编[2015]74号)文件精神,弋江区与芜湖高新技术产业开发区实行“一体化”管理,按照“主官合一、职能分开、相对独立”的原则运行;高新区的规划建设、招商引资、经济发展等职责由高新区管委会承担,行政执法和社会事务等综合管理职责由弋江区政府相关部门统一行使。弋江区科技、招商、建设、财政等工作部门可与高新区管委会内设机构合署办公,对外两块牌子。高新区核心区面积6.5平方公里，拓展区面积35平方公里，辐射区面积178平方公里。
