1999年5月16日河源市委、市政府作出“工业立市”战略决定。2002年7月11日，省政府发文同意建立河源市高新技术开发区。2003年5月19日，河源市委、市政府启动高新区建设。2003年6月28日，高新区管委会正式挂牌成立。2003年7月12日，高新区正式动工建设。2003年9月，高新区首期（2平方公里）开始动工建设。
高新区选址市郊南部，包括白田、高埔、杨子坑等乡村的山地、荒丘，205国道及京九铁路穿越其中，控制和利用土地总面积约40平方公里，其中首期控制和利用土地面积18.3平方公里，首期开发面积约10平方公里。
2019年，河源高新区设立明珠社区居委会、兴业社区居委会。
兴业社区管辖服务范围为河源高新区中心区，辖区面积18平方公里，现有常住人口约7.5万人，办公地点在河源高新区科技八路富民工业园C区。
明珠社区管辖服务范围为明珠工业园、深河产业城和农夫山泉公司等高新区开发区域，面积约10平方公里，现有常住人口近万人，办公地点在明珠开发区工业大道东边、创业二路南边（生活楼A栋17号）。
至此，河源高新区辖2个社区。
