當國民政府播遷到臺灣前，曾成立「東南軍政長官公署」負責蘇、閩、浙、瓊、台等地之政務，隨著蔣總統中正來台，國民政府在東南沿海各島的部隊一一撤離後，東南軍政長官公署自動爲國民政府中央所取代，於一九五零年四月一日裁撤。因此一九五零年後國民政府所轄區域除了臺灣省外，亦有部份福建省及浙江省區域。過去這些區域皆爲前線軍管地區，資料不多且常有管制，來源又分散各書，以致於少有人瞭解其行政區劃沿革。如今整理所見資料，簡單介紹國民政府撤退來台後，所設立的福建省政府及浙江省政府及其下轄各級行政區。
一、浙江省
國民政府設在大陳地區的浙江省只有四年多的設立時間，很快地就成爲歷史。現今這段歷史已經大部份被人所遺忘，僅有部份由大陳地區來台的人士所著的書中，可以查到一二。
行政方面：
大陳島位於浙江省中部沿海台州灣之中的。由上大陳島、下大陳島、蛇山島、蛇腰島、蛇尾島、黃嶼、缸爿島，油菜花嶼，豬腰嶼、孔橫島、困龍山、屏風山、竹南島、西嶼頭島、竹嶼、竹西島、虎頭島、南礁頭島、南礁島、上嶼、石斑島、上嶼南島、中東島、三角島、中嶼、下嶼、旗南島、鳥島、石柱島等29個島嶼及大百畝礁、草鞋礁等83個礁組成，面積14.6平方公里。上、下大陳島爲其主島，兩島總面積11.8平方公里。人口共一萬八千餘人。大陳諸島東瀕東海，介於舟山群島和南麂山列島之間，島嶼巍峨，山勢險要，爲浙江東南海上之要塞，兵家必爭之地。
在一九五一年以前，國民政府在大陸的據點盡失，僅有在浙江東南的大陳列島（台州列島）上，擠滿了衆多撤退到所屬小島的縣政府，這些縣政府計有溫嶺、臨海、黃岩、平陽、三門、樂清、玉環等七縣，實質上除了溫嶺縣尚領有完整的一個鄉建制（鳳尾鄉）外，其他各縣空有名號，所轄之地都非一個完整的鄉。而在各縣之上的國民政府原浙江省政府及浙南行署等，皆已因爲國軍由舟山撤退而撤銷。各縣情況如下：
“溫嶺縣”縣長王仙金，副縣長陳仲秀，以松門爲據點；
“玉環縣”縣長李丕績，副縣長林淼，以披山爲據點；
“臨海縣”縣長敖培才，副縣長陶芝山，以頭門爲據點；
“黃岩縣”縣長林雅，以琅璣山爲據點；
“仙居縣”縣長周子敘；
“磐安縣”縣長兼“縉雲縣”縣長袁德海，副縣長羊榮德、陳秉瑤。
8月中旬，又任命謝力虎爲“平陽縣”縣長，以洞頭島爲據點
蔣總統中正遂派胡宗南將軍化名爲秦東昌，於一九五一年九月赴大陳成立「江浙人民反共遊擊總指揮部」，並以江浙總部爲基礎，相應設立「浙江省政府」。以胡宗南將軍（化名秦東昌）任總指揮兼職“浙江省政府”主席，鍾松爲副總指揮兼軍事處長，沈之岳（化名王明）爲“政治部”主任兼政務處長，程開椿爲經濟處長，周國慶爲漁管處長。1953年一月，中國國民黨中央常務委員會通過胡宗南兼任浙江省黨務特派員。 在沈之嶽的協助下，胡宗南著手進行行政及黨務工作。進而推動各項基礎建設工作，如建立戶政制度，實施地方自治，設立地方行政訓練班，改善環境衛生，鋪設道路，建築碼頭等。
國民政府遷台後所建立的浙江省政府，決定將原來混亂的行政區改劃，於一九五一年十月實施。其中溫嶺、臨海、平陽、玉環等四縣建制保留，黃岩縣及樂清縣撤銷，三門縣則改制爲漁山管理局，同時胡宗南劃定大陳列島中的竹嶼島，爲專門與大陸進行直接貿易的特定區域，爲此特設竹嶼管理局管理該區域的貿易事務。不論是漁山管理局或者是竹嶼管理局，都是爲了管理所在島嶼之貿易事務而設立的。竹嶼管理局設立後一年餘，國民政府的政策開始改變，決定完全斷絕與大陸的任何民間與貿易往來，竹嶼管理局隨之撤銷，改制爲中興村，直屬于溫嶺縣。一年後漁山管理局亦撤銷，改制爲漁山鄉並入臨海縣。
國民政府浙江省所轄之四縣二局，其行政區分別爲：
1. 溫嶺縣：轄上大陳、下大陳、屏風山、上嶼、中嶼、下嶼等各島，並將原有之鳳尾鄉劃分爲復興鄉（上大陳）、成功鄉（下大陳）兩鄉，後又於一九五三年五月十五日，將成功鄉劃分爲成功鎮及克難鄉，並將竹嶼管理局並入改制爲直屬村－－中興村，共計二鄉一鎮及一直屬村。縣政府駐地設于下大陳成功鎮。
2. 臨海縣：轄一江山、頭門、蔣兒 （現名雀兒 ）、田 、石坦、東箕（現名東磯）、小雞冠等各島（東磯列島），劃爲頭門、蔣 、田 等三鄉及臨海新村，後將漁山管理局並入改制爲漁山鄉，共計四鄉。縣政府駐地爲一江山島。
3. 平陽縣：轄平嶼、榮嶼、北麂、南麂等各島，下設南麂區署及四個鄉，縣政府駐地爲南麂島。
4. 玉環縣：轄大麂、小麂、披山、小披、雞冠山、澤嶼、浪鬥前山等各島，劃爲東勝區署及披山鄉（後改稱披裏鄉）、雞山鄉（後改稱雞鳴鄉）兩鄉，縣政府駐地爲披山島。
5. 漁山管理局：轄南魚山、北魚山等各島（魚山列島），後於一九五四年並入臨海縣。
6. 竹嶼管理局：轄竹嶼，後於一九五三年五月間並入溫嶺縣。
軍事方面：
江浙反共救國軍總指揮部未成立前，大陳列島各遊擊隊及情治單位共有３８個單位之多，互不統屬，各自爭雄，甚至有恃力兼併，劫掠別隊財務者。遊擊隊的成份大 致分爲三種：一是抗戰時期的遊擊隊，勝利後並未全部解散，仍保留組織者；二是幫會，主要爲上海一帶的清幫；三爲各縣自衛隊、警察自衛隊等。遊擊隊總人數約 二萬三千人，散佈于浙江東南沿海各島。島上雜牌部隊較多，除王仙金“第三十六縱隊”外，尚有滬松袁國祥“第二十九縱隊”，程慕頤“第三十五縱隊”，王輔弼“第四十縱隊”，張爲邦“海上獨立第一縱隊”及“天目山縱隊”、“雁蕩縱隊”、“寧紹縱隊”等等，
胡宗南於１９５２年二月開始整編，將遊擊隊編組爲六個突擊大隊，一個海上突擊總隊。第一大隊駐上下大陳，大隊長王相義；第 二大隊駐南麂，大隊長徐驤；第三大隊駐漁山，大隊長王樞；第四大隊駐一江山，大隊長王華；第五大隊駐披山，大隊長陳和貴（先）/黎克強（後）；第六大隊駐 上大陳，大隊長程慕頤；海上突擊總隊共有二十八艘各式船艇，下轄六個艇隊，總隊司令先由海軍駐大陳巡防處處長招德培兼任，後由夏季屏接掌。同時，將大陳衛星島嶼劃爲四個作戰區，以曹維漢爲“南麂作戰區”司令，李英奇爲“披山作戰區”司令，程慕頤爲“一江山作戰區”司令，顧錫九爲“漁山作戰區”司令。駐島的國民黨正規軍爲第六十七軍，軍長劉廉一。
一九五三年八月，蔣中正決定改采守勢作戰，爲此將一再對大陸地區發動突襲作戰的胡宗南調回臺灣，浙江省政府亦隨之遷台，僅留下原浙江省政府的政務處，於一九五四年九月一日改制爲「浙江省大陳區行政督察專員公署」繼續治理四縣，行政督察專員則由原政務處長沈之岳擔任。
一九五五年共軍開始發動攻擊，於一九五五年一月二十一日攻佔一江山島，國民政府的臨海縣政府隨之覆滅，大陳列島亦受到極大威脅。國民政府遂決定全面撤出大陳地區，並於一九五五年二月十二日撤離大陳，二月二十五日撤離南麂，浙江省大陳區行政督察專員公署及在臺灣的浙江省政府亦隨之撤銷。總計國民政府所轄之浙江省政府共維繫了四年餘。正由於大陳撤守，政府方決定在福建省轄區內實行戰地政務。
二、福建省
現今國民政府尚領有福建省政府，其領區一般稱爲「金馬地區」，建制上轄有金門縣及連江縣（馬祖列島）兩縣，共計十個鄉鎮。
一九四九年十月福建省政府由軍方全面接管，自福州遷治金門，並於一九四九年十一月撤銷金門縣政府，依金門各駐軍轄區劃分爲金東、金西、烈嶼三區，各設民政處管轄地方行政，三個民政處下共轄城廂、金城、金盤、滄湖、碧湖、金沙、烈嶼、古寧、瓊浦等九個區公所。一九五零年三月將三區民政處合併改設爲「金門軍管區行政公署」，次年（一九五一年）劃設金城、金甯、金湖、金沙、金山、烈嶼等六個區，各區由區公所治理。一九五三年二月金門軍管區行政公署撤銷，恢復金門縣政府建制，並將原來的六區改制爲鄉鎮，同時代管莆田縣的烏丘鄉。
馬祖列島於一九五零年十二月十五日成立「馬祖行政公署」，最初以島爲單位，分設南竿、北竿、白肯、東湧、四礵、岱山、西津、浮鷹等八區，每區設區公所。一九五二年國民政府放棄四礵、岱山、西津、浮鷹四區，餘下四區則依原縣恢復建制。一九五三年二月連江縣恢復建制，將南竿、北竿兩區改爲鄉建制。同年九月長樂縣于白肯區恢復建制，並劃分爲白肯鎮及東肯鄉。一九五四年三月改東湧區爲鄉建制，並於其上恢復羅源縣建制。一九五五年在金門正式恢復福建省政府後，于馬祖設立「閩東北行政公署」，就近督導連江、長樂、羅源等縣之政務。閩東北行政公署後改名爲「福建省第一區行政督察專員公署」。
一九五六年六月國民政府決定在金馬地區實施戰地政務，由金門、馬祖兩地「防衛司令部」下設「政務委員會」負責地方行政，並撤銷「福建省第一區行政督察專員公署」，將長樂及羅源兩縣並入連江縣，莆田則並入金門縣。該年七月十六日「金門防衛司令部政務委員會」及「馬祖地區防衛部政務委員會」成立，實施軍政一元化體系，原有的各縣政府權力虛化。福建省政府亦虛化並遷往臺灣省臺北縣新店鎮，專司研究收復福建地區之重建計畫方案及對大陸福建地區廣播、閩僑聯繫、人才儲備與不屬戰地政務之一般省政工作，不理政務。
一九六九年一月「金門防衛司令部政務委員會」改名爲「金門戰地政務委員會」，直屬國防部，並將部份業務移交金門縣政府掌理，軍方逐漸淡出地方行政體系。其後直到一九九二年十一月七日，金馬地區終止戰地政務，金門縣政府及連江縣政府終於獲得實際治理權。一九九四年底福建省政府由臺灣省臺北縣新店市遷回金門縣辦公，並於一九九六年一月十五日正式遷治金門縣金城鎮。
金門縣最初轄有金城鎮、金甯鎮、金湖鄉、金沙鎮、金山鄉、烈嶼鄉，以及自莆田縣並入之烏丘鄉，一九五九年又增設金瓊鄉，並改金湖爲鎮，一九六五年撤置金山鄉及金瓊鄉，現今金門管轄金門、小金門（烈嶼）、大膽（大擔）、二膽、東碇、北碇、烏丘等島，劃分爲金城鎮、金甯鎮、金湖鎮、金沙鎮、烈嶼鄉、烏丘鄉等四鎮二鄉，面積爲一百五十三平方公里，人口約五萬一千一百人。
連江縣則除了原有的南竿、北竿兩鄉外，長樂縣所屬的白肯鎮及東肯鄉分別改制爲西犬鄉及東犬鄉，羅源縣的東湧鄉則改名爲東引鄉，亦由連江縣管轄，此時連江縣轄有南竿、北竿、西犬、東犬、東引等五鄉。後來西犬、東犬兩島改名爲西莒、東莒，併合並爲莒光鄉。現今連江縣共管轄南竿、北竿、東莒、西莒、東引（東湧）、西引、高登、大丘、小丘、亮島（浪島）等島，劃分爲南竿、北竿、莒光、東引等四鄉，面積約三十平方公里，人口約五千七百人。
