中亚统一电力系统始建于前苏联时期。
中亚地区缺少，但吉尔吉斯和塔吉克在锡尔河和阿姆河的上游地区，来自帕米尔高原的冰雪融水丰富，发电量大，但是两个地区工业较弱，发电量其实过剩。乌兹别克和哈萨克处于下游地区，工业基础好。
苏联时期，莫斯科统一安排，吉尔吉斯和塔吉克在夏季水量充足时，将剩余发电量输往其余三个国家;在冬季水量下降,发电量不足时,上述三国为吉尔吉斯和塔吉克提供电力、石油等保障。这就是中亚统一电力系统的来源,它不仅是原苏联中亚地区成员国间分配电力使用的发电和输电网络,同时还具有调节各国水电站排水量以满足农田灌溉的作用。这样,水电将中亚五国紧密联系在一起。
随着苏联的解体,问题开始浮出水面。乌兹别克首先根据《国际水资源公约》,认为河流上下游国家应共同享有水资源,要求上游两国按国际惯例分配水资源,保障夏季灌溉用水,并不愿意再在冬季提供电力保障。为此,吉尔吉斯和塔吉克两国被迫改变境内水利设施的功能,在春夏季下游需要农业灌溉的时候关闸蓄水,在冬季放水发电满足自身需要。至此,吉尔吉斯和塔吉克两国冬季能源不足,而下游的乌兹别克和哈萨克等国则由于灌溉用水的不足致使耕地面积减少、农作物产量下降、居民生活条件恶化,各国关系逐渐紧张,出现恶性循环的局面。
土库曼已经在2003年6月第一个退出中亚统一电力系统。 乌兹别克也在2009年宣布退出。最近10年以来,哈萨克多次计划脱离中亚联合电力系统。2009年2月26日至3月11日,由于中亚地区各国电力供需失衡,哈萨克本国的电力系统不得不脱离中亚联合电力系统。2009年10月也提出了退出中亚联合电力系统的计划，但目前未实现退出计划。
