随着温州地铁M线（M1-M4线）的规划公开，以及市域铁路的S1线和S2线建设，S3线显然基本会取消，将M1线延伸作为S3线会成为必然；但随着龙港市的成立，以及温州南部副都市
中心的发展需要，南部S3线不应该被取消，南部S3线可以接入S2线，并新规划南部龙港市和鳌江镇为中心的S4线，南部S3线和S4线以高架为主，降低建设成本，打通平阳火车站和苍南火车站，弱化沿海高铁的龙港市走向，打通江南平原龙港、宜山、钱库、金乡四个市镇之间除龙金大道之外的第二通道，并发展新苍南县滨海新城的赤溪围垦建设，提升龙港市的市域
轨道交通出行，及与周边
乡镇的连接和带动引领作用。
S4线的三个
方案分别由平阳站、平阳县城、瑞安站延伸至赤溪，打通瑞安站，平阳县
行政文化中心，平阳县
人民医院，平阳站，平阳县中医院，龙港商务中心，龙港客运中心，龙港世纪新城，宜山镇，钱库镇，龙港市芦浦和舥艚，金乡镇，赤溪围垦区，与龙港市S3线的新城站、江山站、平等站、云岩站构成龙港市域轨道交通网。
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