“喀什”为“喀什噶尔”（Kashgar）的简称，其名最早见于唐《慧超往五天竺国传》的“Kashgiri”（伽师祗离国），后人记“Kashgri”即“迦师舍黎”，新、旧《唐书》中记疏勒国“王居伽师城”，《洛阳伽蓝记》、《高僧传》记为“沙勒”，《一切经音义》记为“迦师佶黎”，喀喇汗王朝建立后称“喀什噶尔”，此后，史书即沿用此名，元称“可失哈耳”、“乞思合尔”、“可失哈里”、“乞失哈里”、“合失合儿”，明时疏勒国为“哈实哈尔”、“哈失哈尔”、“哈失哈”，清后定为“喀什噶尔”。至新中国成立前，“喀什噶尔”一直指今疏勒县、疏附县和喀什市一带。国外史地学界变读“喀什噶尔”为“喀什噶利亚”，其实为一地理界限名称，泛指天山以南的新疆各地。
“喀什噶尔”一名是古突厥语还是古粟特语现已无法考证。在突厥语里，“喀什噶尔”是“玉石的集散地”，因在其东边的和阗（今和田市）一直出产举世的昆仑玉，而喀什噶尔正好是中亚商业贸易城，于是玉石就被商贩贩运到喀什噶尔及更遥远的西方或东方。
《西域水道记》载“喀什噶尔”为“回语（即今维吾尔语）谓‘各色’为‘喀什’（Kash），‘砖屋’为‘噶尔’（Gar），地富庶多砖也”，也有译“噶尔”为“地区”、“邦国”之意。《西域同文志》载“喀什，谓各色；噶尔，谓砖房。其地富庶，多砖房，故名”。古于阗塞语释其为“玉石之城（地）”，古吐蕃语释其为“玉石集散地”，瓦罕语（阿富汗语）释其为“玉市”或“玉山”，古波斯语释其为“农夫”，古突厥语另释其为“四方形”、“十字路口”。
今喀什市有“恰萨”（巷、街道办事处，也作“恰斯”），疑“恰萨”（“恰斯”）为“喀什”之延意。
