元至元十三年（1276），改博州为东昌路总管府，聊城县为路治所。东昌作为境内建制名称，始见于此。
明洪武元年（1368），改东昌路为东昌府。
明、清聊城县均为东昌府治，其县西境仍为堂邑县。
1912年，山东省废府设道，境域为济西道，1914年改为东临道，聊城县均为治所。1928年废道，境内各县直属山东省。
1937年1月属国民党山东省第六行政督察区，并为行政督察专员公署驻地。
1943年，堂邑县改名为武训县。1949年复名堂邑县，属聊城专区。
1949年8月20日，聊城专区成立，属新设的平原省，专署驻聊城县。辖聊城、阳谷、东阿、茌平、博平、堂邑、清平、冠县、莘县、高唐、寿张等11县及聊城城关区（县级）。
1951年3月撤销聊城城关区，改设为镇，划归聊城县。
1952年濮县、范县、观城、朝城4县由原平原省濮阳专区划归聊城专区。
1952年7月，观城县与朝城县合并为观朝县，县治在朝城镇。
1952年11月，平原省撤销，聊城专区还属山东省，临清县、临清镇、馆陶县由河北邯郸专区划归山东德州专区。
1952年12月，馆陶县，临清县，临清镇由德州专区划归聊城专区。
1954年撤销临清镇设县级临清市。
1956年2月德州专区撤销， 德州市及夏津、武城、德县、平原、禹城、齐河、恩县七县划入聊城专区；同年撤销博平、濮县、恩县、观朝、堂邑、清平六县。
1958年东平、平阴、肥城、乐陵、临邑、商河、济阳七县划入；同年撤销武城、乐陵、济阳、平阴、临清、馆陶、阳谷、莘县、东阿、禹城、德县、聊城等县，临清县与临清市合并为临清市（县级），聊城县改置聊城市（县级），德县并入平原县、德州市。
1960年撤销东平县；肥城县划归济南市，商河县改名乐陵县并与临邑县划归淄博专区。
1961年9月恢复德州专区，德州市及夏津、平原、齐河三县划归德州专区，恢复馆陶、阳谷、东阿、莘县四县；
1963年撤聊城市设聊城县，撤临清市设临清县。
1964年撤销寿张县；范县划归河南省。
1965年馆陶县划归河北省。
1967年改置聊城地区。
1983年再度置聊城市，临清市，由聊城地区代管。
1997年8月聊城地区和县级聊城市被撤销，设立地级聊城市，原县级聊城市改置为东昌府区。
