2000年2月2日，西龙目县Kabupaten Lombok Barat将首府从马塔兰Mataram迁至格隆Gerung
2000年4月10日，桑义赫和塔劳群岛县Kabupaten Kepulauan Sangihe dan Talaud拆分为桑义赫群岛县Kabupaten Kepulauan Sangihe和塔劳群岛县KabupatenKepulauan Talaud
2000年11月21日，邦加-勿里洞省Provinsi Kepulauan Bangka Belitung从南苏门答腊省Provinsi Sumatera Selatan分出
2000年12月22日，哥伦打洛省Provinsi Gorontalo从北苏拉威西省Provinsi SulawesiUtara分出
2001年亚齐特别自治区Daerah Istimewa Aceh更名亚齐达鲁萨兰省Nanggroë Aceh Darussalam
2001年6月21日，巴务巴务市Kota Bau-Bau从布顿县Kabupaten Buton分出
2001年6月21日，司马威市Kota Lhokseumawe从北亚齐县Kabupaten Aceh Utara分出，北亚齐县Kabupaten AcehUtara将首府从司马威Lhokseumawe迁至洛克苏昆Lhoksukon
2001年6月21日，卢布林高市Kota Lubuklinggau从穆西拉瓦斯县Kabupaten Musi Rawas分出，穆西拉瓦斯县将首府从卢布林高Lubuklinggau迁至麻拉比利提Muara Beliti
2001年6月21日，帕加拉兰市Kota Pagar Alam从拉哈特县Kabupaten Lahat分出
2001年6月21日，芝马墟市Kota Cimahi从万隆县KabupatenBandung分出
2001年10月17日，山口洋市Kota Singkawang从孟嘉影县Kabupaten Bengkayang分出
2001年10月17日，兰沙市Kota Langsa从东亚齐县KabupatenAceh Timur分出，东亚齐县Kabupaten Aceh Timur将首府从兰沙Langsa迁至伊迪拉亚Idi Rayeuk
2001年10月17日，丹戎槟榔市Kota Tanjung Pinang从廖内群岛县KabupatenKepulauan Riau分出
2001年10月17日，普拉布穆利市Kota Prabumulih从麻拉埃宁县Kabupaten Muara Enim分出
2001年10月17日，打横市Kota Tasikmalaya从打横县Kabupaten Tasikmalaya分出，打横县KabupatenTasikmalaya将首府从打横Tasikmalaya迁至新加帕尔纳Singaparna
2001年10月17日，巴图市Kota Batu从玛琅县KabupatenMalang分出
2001年12月，伊里安查亚省Provinsi Irian Jaya改名巴布亚省Provinsi Papua
2002年，南索龙县Kabupaten Sorong Selatan从索龙县Kabupaten Sorong分出
2002年，凯马纳县Kabupaten Kaimana从法克法克县Kabupaten Fakfak分出
2002年，马马沙县Kabupaten Mamasa从波里哇利曼达县Kabupaten Polewali Mandar分出
2002年，罗地岛县Kabupaten Rote Ndao从古邦县Kabupaten Kupang分出
2002年2月18日，沙哇伦多锡戎戎县Kabupaten Sawahlunto Sijunjung更名为锡戎戎县Kabupaten Sijunjung
2002年4月10日，帕里吉牟通县KabupatenParigi Moutong从栋加拉县Kabupaten Donggala分出
2002年4月10日，帕洛波市Kota Palopo从鲁乌县Kabupaten Luwu分出
2002年4月10日，北佩纳占巴塞县KabupatenPenajam Paser Utara从巴西县Kabupaten Pasir分出
2002年4月10日，卡廷岸县Kabupaten Katingan从东哥打瓦灵因县Kabupaten Kotawaringin Timur分出
2002年4月10日，拉曼道县KabupatenLamandau、苏卡马拉县Kabupaten Sukamara、塞鲁延县Kabupaten Seruyan从西哥打瓦灵因县KabupatenKotawaringin Barat分出
2002年4月10日，东巴里托县KabupatenBarito Timur从南巴里托县Kabupaten Barito Selatan分出
2002年4月10日，穆戎拉亚县KabupatenMurung Raya从北巴里托县Kabupaten Barito Utara分出
2002年4月10日，马斯火山县KabupatenGunung Mas、普朗皮骚县Kabupaten Pulang Pisau从卡普阿斯县Kabupaten Kapuas分出
2002年4月10日，比马市Kota Bima从比马县Kabupaten Bima分出
2002年4月10日，西南亚齐县KabupatenAceh Barat Daya从南亚齐县Kabupaten Aceh Selatan分出
2002年4月10日，亚齐查亚县KabupatenAceh Jaya、纳甘拉雅县Kabupaten Nagan Raya从西亚齐县Kabupaten Aceh Barat分出
2002年4月10日，亚齐塔米扬县KabupatenAceh Tamiang从东亚齐县Kabupaten Aceh Timur分出
2002年4月10日，加尤路易斯县KabupatenGayo Lues从东南亚齐县Kabupaten Aceh Tenggara分出
2002年4月10日，班裕阿辛县KabupatenBanyuasin从穆西班裕阿辛县Kabupaten Musi Banyuasin分出
2002年7月2日，帕里亚曼市KotaPariaman从巴东帕里亚曼县Kabupaten Padang Pariaman分出
2002年9月4日，廖内群岛省ProvinsiKepulauan Riau从廖内省Provinsi Riau分出
2002年11月11日，宾图尼湾县KabupatenTeluk Bintuni从法克法克县Kabupaten Fakfak分出
2002年11月12日，奇隆县KabupatenKeerom、萨米县Kabupaten Sarmi从查亚普拉县KabupatenJayapura分出
2002年11月12日，阿斯马特县KabupatenAsmat、波文迪哥尔县Kabupaten Boven Digoel、马皮县Kabupaten Mappi从马老奇县Kabupaten Merauke分出
2002年11月12日，宾坦山县Kabupaten Pegunungan Bintan、托利卡拉县Kabupaten Tolikara、亚胡基摩县Kabupaten Yahukimo从查亚维查亚县Kabupaten Jayawijaya分出
2002年11月12日，瓦洛彭县Kabupaten Waropen从亚彭瓦洛彭县Kabupaten Yapen Waropen分出
2002年12月1日，班贾尔市Kota Banjar从尖米士县KabupatenCiamis分出
2003年，阿鲁群岛县Kabupaten Kepulauan Aru从东南马鲁古县Kabupaten Maluku Tenggara分出
2003年，托约乌纳乌纳县Kabupaten Tojo Una-Una从波索县Kabupaten Poso分出
2003年，墨拉威县Kabupaten Melawi从新当县Kabupaten Sintang分出
2003年，塞卡道县Kabupaten Sekadau从桑高县Kabupaten Sanggau分出
2003年1月27日，西芒加莱县Kabupaten Manggarai Barat从芒加莱县Kabupaten Manggarai分出
2003年2月25日，北马鲁古县Kabupaten Maluku Utara拆分为西哈马黑拉县Kabupaten Halmahera Barat、北哈马黑拉县KabupatenHalmahera Utara、南哈马黑拉县Kabupaten Halmahera Selatan、苏拉群岛县Kabupaten Kepulauan Sula
2003年2月25日，波恩波兰戈县KabupatenBone Bolango从哥伦打洛县Kabupaten Gorontalo分出
2003年2月25日，波胡瓦多县KabupatenPohuwato从博阿勒摩县Kabupaten Boalemo分出
2003年2月25日，北马穆朱县KabupatenMamuju Utara从马穆朱县Kabupaten Mamuju分出
2003年2月25日，南科纳韦县KabupatenKonawe Selatan从科纳韦县Kabupaten Konawe分出
2003年2月25日，巴兰安县KabupatenBalangan从北河源县Kabupaten Hulu Sungai Utara分出
2003年2月25日，南尼亚斯县KabupatenNias Selatan从尼亚斯县Kabupaten Nias分出
2003年2月25日，帕克帕克巴拉特县KabupatenPakpak Bharat从代里县Kabupaten Dairi分出
2003年2月25日，西邦加县Kabupaten Bangka Barat、南邦加县Kabupaten Bangka Selatan、中邦加县KabupatenBangka Tengah从邦加县Kabupaten Bangka分出
2003年2月25日，东勿里洞县Kabupaten Belitung Timur从勿里洞县Kabupaten Belitung分出
2003年4月8日，丹那本布县KabupatenTanah Bumbu从哥打巴鲁县Kabupaten Kotabaru分出
2003年4月12日，拉贾安帕县KabupatenRaja Ampat从索龙县Kabupaten Sorong分出
2003年4月12日，温达马湾县KabupatenTeluk Wondama从马诺夸里县Kabupaten Manokwari分出
2003年5月3日，东鲁乌县Kabupaten Luwu Timur从北鲁乌县Kabupaten Luwu Utara分出
2003年5月31日，蒂多雷群岛市Kota Tidore Kepulauan、东哈马黑拉县KabupatenHalmahera Timur从中哈马黑拉县Kabupaten Halmahera Tengah分出
2003年6月9日，考尔县Kabupaten Kaur、塞鲁马县Kabupaten Seluma从南明古鲁县Kabupaten BengkuluSelatan分出
2003年6月9日，穆科穆科县Kabupaten Mukomuko从北明古鲁县Kabupaten Bengkulu Utara分出
2003年6月18日，林加县KabupatenLingga从廖内群岛县Kabupaten Kepulauan Riau分出
2003年7月28日，胡邦哈孙都坦县KabupatenHumbang Hasundutan从北塔帕努里县Kabupaten Tapanuli Utara分出
2003年8月4日，托莫洪市KotaTomohon从米纳哈萨县Kabupaten Minahasa分出
2003年8月4日，南米纳哈萨县KabupatenMinahasa Selatan从米纳哈萨县Kabupaten Minahasa分出
2003年11月14日，西伊里安查亚省ProvinsiIrian Jaya Barat从巴布亚省Provinsi Papua分出
2003年12月18日，苏皮奥里县KabupatenSupiori从比亚克农福尔县Kabupaten Biak Numfor分出
2003年12月18日，西塞兰县Kabupaten Seram Bagian Barat、东塞兰县Kabupaten Seram Bagian Timur从中马鲁古县KabupatenMaluku Tengah分出
2003年12月18日，北米纳哈萨县Kabupaten Minahasa Utara从米纳哈萨县Kabupaten Minahasa分出
2003年12月18日，邦巴纳县KabupatenBombana从布顿县Kabupaten Buton分出
2003年12月18日，北科拉卡县KabupatenKolaka Utara从科拉卡县Kabupaten Kolaka分出
2003年12月18日，哇卡托比县KabupatenWakatobi从布顿县Kabupaten Buton分出
2003年12月18日，西松巴哇县KabupatenSumbawa Barat从松巴哇县Kabupaten Sumbawa分出
2003年12月18日，贝内尔美利亚县KabupatenBener Meriah从中亚齐县Kabupaten Aceh Tengah分出
2003年12月18日，沙摩西县KabupatenSamosir从多巴沙摩西县KabupatenToba Samosir分出
2003年12月18日，沙登贝达盖县KabupatenSerdang Bedagai从德利沙登县Kabupaten Deli Serdang分出
2003年12月18日，西巴萨曼县KabupatenPasaman Barat从巴萨曼县Kabupaten Pasaman分出
2003年12月18日，克帕希昂县Kabupaten Kepahiang、乐朋县Kabupaten Lebong从拉让乐朋县Kabupaten RejangLebong分出
2003年12月18日，奥根伊利尔县Kabupaten Ogan Ilir从奥根科美林伊利尔县Kabupaten Ogan Komering Ilir分出
2003年12月18日，南奥根科美林乌鲁县Kabupaten Ogan Komering UluSelatan、东奥根科美林乌鲁县Kabupaten Ogan Komering Ulu Timur从奥根科美林乌鲁县Kabupaten Ogan Komering Ulu分出
2004年1月7日，德哈马斯拉雅县Kabupaten Dharmasraya从锡戎戎县Kabupaten Sijunjung分出
2004年1月7日，南索洛克县KabupatenSolok Selatan从索洛克县Kabupaten Solok分出
2004年6月6日，勿加泗县Kabupaten Bekasi将首府从勿加泗Bekasi迁至西卡朗Cikarang
2004年10月5日，西苏拉威西省Provinsi Sulawesi Barat从南苏拉威西省Provinsi Sulawesi Selatan分出
2004年10月18日，廖内群岛县KabupatenKepulauan Riau将首府从丹戎槟榔Tanjungpinang迁至斯里本淡市Bandar Seri Bentan
2005年4月2日，索洛克县KabupatenSolok将首府从索洛克Solok迁至阿罗苏卡Arosuka
2006年2月13日，鲁乌县KabupatenLuwu将首府从帕洛波Palopo迁至贝洛帕Belopa
2006年2月23日，廖内群岛县KabupatenKepulauan Riau更名宾坦县Kabupaten Bintan
2007年，图阿尔市Kota Tual从东南马鲁古县Kabupaten Maluku Tenggara分出，东南马鲁古县KabupatenMaluku Tenggara将首府从图阿尔Tual迁至朗格Langgur
2007年1月2日，哥打莫巴谷市Kota Kotamobagu、北巴兰莫甘陡县Kabupaten Bolaang Mongondow Utara从巴兰莫甘陡县Kabupaten Bolaang Mongondow分出
2007年1月2日，东南米纳哈萨县Kabupaten Minahasa Tenggara从南米纳哈萨县Kabupaten Minahasa Selatan分出
2007年1月2日，北哥伦打洛县Kabupaten Gorontalo Utara从哥伦打洛县Kabupaten Gorontalo分出
2007年1月2日，北布顿县Kabupaten Buton Utara从布顿县Kabupaten Buton分出
2007年1月2日，北喀永县Kabupaten Kayong Utara从吉打邦县Kabupaten Ketapang分出
2007年1月2日，苏布鲁萨兰市Kota Subulussalam从亚齐辛基尔县Kabupaten Aceh Singkil分出
2007年1月2日，皮迪查亚县Kabupaten Pidie Jaya从皮迪县Kabupaten Pidie分出
2007年1月2日，西万隆县Kabupaten Bandung Barat从万隆县Kabupaten Bandung分出
2007年2月7日，西伊里安查亚省Provinsi Irian Jaya Barat更名为西巴布亚省Provinsi Papua Barat
2007年3月15日，马姆贝拉莫拉亚县Kabupaten Mamberamo Raya从萨米县Kabupaten Sarmi和瓦洛彭县Kabupaten Waropen分出
2007年4月20日，安帕特劳望县Kabupaten Empat Lawang从拉哈特县Kabupaten Lahat分出
2007年5月3日，西奥塔哥兰当比阿罗群岛县Kabupaten Kepulauan SiauTagulandang Biaro从桑义赫群岛县Kabupaten Kepulauan Sangihe分出
2007年5月22日，纳戈切县Kabupaten Nagekeo从纳达县Kabupaten Ngada分出
2007年5月22日，西南松巴县Kabupaten Sumba Barat Daya、中松巴县Kabupaten Sumba Tengah从西松巴县Kabupaten SumbaBarat分出
2007年6月15日，巴图巴拉县Kabupaten Batubara从阿萨汗县Kabupaten Asahan分出
2007年7月2日，北科纳韦县Kabupaten Konawe Utara从科纳韦县Kabupaten Konawe分出
2007年7月17日，塔纳蒂敦县Kabupaten Tana Tidung从布伦干县Kabupaten Bulungan分出
2007年7月17日，库布拉亚县Kabupaten Kubu Raya从坤甸县Kabupaten Pontianak分出
2007年7月17日，东芒加莱县Kabupaten Manggarai Timur从芒加莱县Kabupaten Manggarai分出
2007年8月10日，巴东老越县Kabupaten Padang Lawas、北巴东老越县Kabupaten Padang Lawas Utara从南塔帕努里县Kabupaten Tapanuli Selatan分出，南塔帕努里县Kabupaten Tapanuli Selatan将首府从巴东石林潘PadangSidempuan迁至西皮罗Sipirok
2007年8月22日，巴西县Kabupaten Pasir更名巴塞县Kabupaten Paser
2007年11月2日，帕萨瓦兰县Kabupaten Pesawaran从南楠榜县Kabupaten Lampung Selatan分出
2007年11月2日，西冷市Kota Serang从西冷县KabupatenSerang分出，西冷县Kabupaten Serang将首府从西冷Serang迁至锡卢阿斯Ciruas
2008年，西南马鲁古县Kabupaten Maluku Barat Daya从西东南马鲁古县Kabupaten Maluku Tenggara Barat分出
2008年，下若坎县Kabupaten Rokan Hilir将首府从乌戎丹戎Ujung Tanjung迁至峇眼亚比Bagansiapiapi
2008年1月4日，多吉亚伊县Kabupaten Dogiyai从纳比雷县Kabupaten Nabire分出
2008年1月4日，兰尼查亚县Kabupaten Lanny Jaya、中马姆贝拉莫县Kabupaten Mamberamo Tengah、恩杜加县KabupatenNduga、雅利摩县Kabupaten Yalimo从查亚维查亚县Kabupaten Jayawijaya分出
2008年2月28日，玛琅县Kabupaten Malang将首府从玛琅Malang迁至克潘柬Kepanjen
2008年5月19日，亚彭瓦洛彭县KabupatenYapen Waropen更名为亚彭群岛县Kabupaten Kepulauan Yapen
2008年6月23日，锡马伦温县KabupatenSimalungun将首府从先达Kota Pematang Siantar迁至拉亚Raya
2008年6月24日，中明古鲁县KabupatenBengkulu Tengah从北明古鲁县Kabupaten Bengkulu Utara分出
2008年7月21日，南布鲁县KabupatenBuru Selatan从布鲁县Kabupaten Buru分出
2008年7月21日，西吉县KabupatenSigi从栋加拉县KabupatenDonggala分出
2008年7月21日，南拉布汉巴图县KabupatenLabuhanbatu Selatan、北拉布汉巴图县Kabupaten Labuhanbatu Utara从拉布汉巴图县Kabupaten Labuhanbatu分出
2008年7月21日，双溪珀努市KotaSungaipenuh从葛林芝县Kabupaten Kerinci分出
2008年7月24日，阿南巴斯群岛县KabupatenKepulauan Anambas从纳土纳县Kabupaten Natuna分出
2008年9月30日，南巴兰莫甘陡县KabupatenBolaang Mongondow Selatan、东巴兰莫甘陡县Kabupaten BolaangMongondow Timur从巴兰莫甘陡县分出
2008年10月29日，顶峰县KabupatenPuncak从查亚峰县Kabupaten Puncak Jaya分出
2008年10月29日，德延县KabupatenDeiyai、因潭查亚县Kabupaten Intan Jaya从帕尼艾县Kabupaten Paniai分出
2008年10月29日，摩罗泰岛县KabupatenPulau Morotai从北哈马黑拉县Kabupaten Halmahera Utara分出
2008年10月29日，古农西托利市KotaGunungsitoli从尼亚斯县Kabupaten Nias分出，尼亚斯县Kabupaten Nias将首府从古农西托利Gunungsitoli迁至吉多Gido
2008年10月29日，迈苏基县KabupatenMesuji、西图朗巴望县Kabupaten Tulang Bawang Barat从图朗巴望县Kabupaten Tulang Bawang分出
2008年10月29日，普林塞乌县KabupatenPringsewu从汤加穆斯县Kabupaten Tanggamus分出
2008年11月26日，北托拉查县KabupatenToraja Utara从塔纳托拉查县Kabupaten Tana Toraja分出
2008年11月26日，萨武县KabupatenSabu Raijua从古邦县Kabupaten Kupang分出
2008年11月26日，西尼亚斯县KabupatenNias Barat、北尼亚斯县Kabupaten Nias Utara从尼亚斯县Kabupaten Nias分出
2008年11月26日，南唐格朗市KotaTangerang Selatan从唐格朗县Kabupaten Tangerang分出
2008年12月30日，北龙目县KabupatenLombok Utara从西龙目县Kabupaten Lombok Barat分出
2008年12月30日，巴东帕里亚曼县KabupatenPadang Pariaman将首府从帕里亚曼Pariaman迁至马林塘沟Parit Malintang
2009年亚齐特区Nanggroë Aceh Darussalam更名亚齐省Provinsi Aceh
2009年1月16日，梅布拉特县KabupatenMaybrat从南索龙县Kabupaten Sorong Selatan分出
2009年1月16日，莫兰蒂群岛县KabupatenKepulauan Meranti从望加丽县Kabupaten Bengkalis分出
2009年1月25日，坦布劳乌县Kabupaten Tambrauw从索龙县Kabupaten Sorong和马诺夸里县Kabupaten Manokwari分出
2010年1月5日，勿里达县KabupatenBlitar将首府从勿里达Blitar迁至卡尼戈罗Kanigoro
2010年1月5日，谏义里县KabupatenKediri将首府从谏义里Kediri迁至纳桑姆Ngasem
2010年1月5日，庞越县Kabupaten Probolinggo将首府从庞越Probolinggo迁至克拉克萨安Kraksaan
2010年1月22日，巴兰莫甘陡县KabupatenBolaang Mongondow将首府从哥打莫巴谷Kota Kotamobagu迁往洛拉Lolak
2010年8月4日，北马鲁古省Provinsi Maluku Utara法定首府从特尔纳特Ternate改为索菲菲Sofifi
2010年8月4日，茉莉芬县KabupatenMadiun将首府从茉莉芬Madiun迁至恰鲁班Caruban
2010年10月22日，古邦县KupangRegency将首府从古邦Kupang迁至奥厄拉马西Oelamasi
2011年4月18日，葛林芝县KabupatenKerinci将首府从双溪珀努Sungaipenuh迁至西乌拉Siulak
2012年10月25日，北加里曼丹省ProvinsiKalimantan Utara从东加里曼丹省Provinsi Kalimantan Timur分出
2012年10月25日，南马诺夸里县KabupatenManokwari Selatan、阿尔法克山县Kabupaten Pegunungan Arfak从马诺夸里县Kabupaten Manokwari分出
2012年10月25日，西滨海县KabupatenPesisir Barat从西楠榜县Kabupaten Lampung Barat分出
2012年10月25日，庞岸达兰县Kabupaten Pangandaran从尖米士县Kabupaten Ciamis分出
2012年12月14日，塔利亚布岛县Kabupaten Pulau Taliabu从苏拉群岛县KabupatenKepulauan Sula分出
2012年12月14日，邦盖海县Kabupaten Banggai Laut从邦盖群岛县KabupatenBanggai Kepulauan分出
2012年12月14日，中马穆朱县Kabupaten Mamuju Tengah从马穆朱县Kabupaten Mamuju分出
2012年12月14日，马拉加县Kabupaten Malaka从贝鲁县Kabupaten Belu分出
2013年1月2日，巴塞县KabupatenPaser首府塔纳格罗戈Tanah Grogot更名为塔纳巴塞TanaPaser（东加里曼丹省政府于2011年12月1日批准）
2013年1月11日，佩努考阿巴布勒马唐伊利尔县Kabupaten Penukal Abab Lematang Ilir从麻拉埃宁县KabupatenMuara Enim分出
2013年4月12日，北莫罗瓦利县Kabupaten Morowali Utara从莫罗瓦利县KabupatenMorowali分出
2013年4月12日，科纳韦群岛县Kabupaten Konawe Kepulauan从科纳韦县Kabupaten Konawe分出
2013年4月22日，东科拉卡县Kabupaten Kolaka Timur从科拉卡县Kabupaten Kolaka分出
2013年5月20日，马哈坎乌鲁县Kabupaten Mahakam Ulu从西库台县Kabupaten Kutai Barat分出
2013年6月11日，北穆西拉瓦斯县Kabupaten Musi Rawas Utara从穆西拉瓦斯县Kabupaten Musi Rawas分出
2014年7月21日，坤甸县Kabupaten Pontianak更名曼帕瓦县Mempawah Regency
2014年7月23日，西木纳县Kabupaten Muna Barat从木纳县Kabupaten Muna分出
2014年7月24日，南布顿县Kabupaten Buton Selatan、中布顿县Kabupaten Buton Tengah从布顿县Kabupaten Buton分出
莫佐克托县Kabupaten Mojokerto正在逐渐将首府从莫佐克托Mojokerto迁至马约萨里Mojosari
比马县Kabupaten Bima首府已从拉巴Raba迁至沃哈Woha
中塔帕努里县Kabupaten TapanuliTengah首府已从实武牙Sibolga迁至潘丹Pandan
蓝色：具体时间不知
橙色：年份不知
我整理的一点资料，可能有遗漏或者错误，大家帮忙补充一下
