1947年，印度与锡金签订《维持现状协定》，继续往锡金派驻专员。受印度扶持的锡金国家大会党发起“不合作运动”，要求国王]进行“改革”。同年５月９日，国家大会党政府正式成立，但遭锡金王族]强烈反对，群众运动也日渐兴起。1949年6月初，印度以“防止动乱和流血”为由，派兵进驻锡金，接管了成立不到一个月的新政府，并委任印度人拉尔为锡金首相。1950年12月签订“印度和锡金和平条约”，规定锡金为印度的“保护国”，印度控制锡金的国防、外交、经济等大权。1968年8月，甘托克爆发反印示威，要求废除“印度和锡金和平条约”。1973年4月印度对锡金实行军事占领。1974年6月20日，锡金议会通过了由印度拟定的锡金宪法，规定印度政府派驻的首席行政官为政府首脑和议会议长。同年9月《印度宪法修正案》规定锡金为印度的“联系邦”，在印度两院各为锡金设一个议席。锡金现已完全被印度吞并，除了纳穆加尔王朝第十三世国王仍流亡纽约寻求他的王国重获独立以外，大部分锡金人民──或者说大部分居住在锡金的人民──早已认同印度对锡金的主权。
1975年，印度军队解散锡金国王的宫廷卫队，软禁了锡金国王。同年4月10日，锡金议会通过决议废黜国王，把锡金变为印度的一个邦。4月14日，锡金又为此举行举行“全民投票”，决定锡金的未来，过后印度议会通过决议，正式把锡金变为印度的一个邦。
1975年，锡金被印度共和国吞并为一个邦。锡金邦有人口约60万，是印度人口最少的邦。该邦在印度各邦中的土地面积大小排名为倒数第二，仅大于果阿邦。
中华人民共和国政府过去一直不承认印度对锡金拥有主权，按照印度媒体的说法，中国是世界上最后一个还承认锡金是一个独立国家的国家。这态度直到与印度协商达成“互相承认”——即印度承认台湾属我国领土的2003年才有所松动2005年4月18日，根据中国政府有关部门的通知精神，国家测绘局行业管理司正式下发《关于地图上锡金表示方法变更的通知》，从此中国出版的地图上不再把锡金标示为主权国家。人民教育出版社2005年版的初中义务教育《历史与社会》教材也把中国的陆上邻国从原来的15个改为14个，删去了锡金。
乃堆拉山口位于中国西藏日喀则地区与印度锡金邦的交界处，海拔4500米左右，是世界上最高的公路贸易通道，也是中印之间条件相对较好的陆路贸易通道，每年4～10月适于人通过。山口距锡金邦首府甘托克54公里，距西藏亚东52公里，距拉萨429公里，是连接中印陆路贸易最短的通道。中国和印度于2006年7月6日重新开放连接西藏和锡金的乃堆拉山口边贸通道，恢复两国中断40多年的边境贸易。但由于印度政府官僚主义等因素，乃堆拉山口边贸发展阻滞。
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