管理体制：设立济宁经济技术开发区党工委、管委会
设立中国******济宁市委员会济宁经济技术开发区工作委员会、济宁经济技术开发区管理委员会（以下简称济宁经济技术开发区党工委和管委会）。济宁经济技术开发区党工委、管委会分别为市委、市政府的派出机构，代表市委、市政府对济宁经济技术开发区实施统一领导、统一规划和统一管理。
济宁经济技术开发区采取管辖分离管理模式，将原嘉祥高新技术产业开发区、嘉祥经济开发区和嘉祥县疃里镇、马集镇的人财物以2013年为基期，整建制一次性划归济宁经济技术开发区，经济发展、社会事务管理均由济宁经济技术开发区负责。济宁经济技术开发区的地区生产总值、财政收入、投资等主要经济指标列入嘉祥县统计。
济宁经济技术开发区财政独立，隶属市财政管理，封闭运行。市财政自2014年起，五年内每年提供2亿元的发展资金支持。济宁经济技术开发区范围内上级补助的社会事业支出、民生支出等转移支付由市财政拨付。
机构设置：济宁经济技术开发区人员编制由市统一管理
根据工作需要，按照“精简、统一、效能”的原则，济宁经济技术开发区党工委和管委会内设党政办公室、经济发展局、社会事业局、开发建设局、财政局、投资招商局。根据济宁经济技术开发区发展需要，市规划局、市国土局、市公安局按程序报批后，先期设立派驻机构。其他派驻机构的设立，由市直相关部门根据需要按程序报批后设置。济宁经济技术开发区人员编制由市统一管理。
