建议还是保留目前地市州模式，将部分地域相近，人口集中有潜力发展成经济政治中心的城市定位区域中心城市——如喀什，并适当合并目前地市升级成副省级，实现另类模式的省县直辖。
对于已经形成区域中心的地区如和田，阿克苏还是保留地级区/市比较好，对老百姓办事方便。
对于历史上已经实现副省级——县市直辖的伊犁州保留现状就挺好。
至于乌鲁木齐昌吉州合并已经成为事实，是经济发展使然，适当考虑都市圈升级带一把吐鲁番，哈密建立副省级直辖市（新鲜吧，就是行政上属于新疆但是经济上中央直管的一种模式）作为新疆省/区的行政经济政治中心。
整个新疆分为一个副省级市（乌市），两个副省级州（伊犁，喀什），三个地级州（阿克苏，和田巴州）六个二级行政单位的格局。二级单位下面直辖县市，县市下面辖乡镇，再往下就是村居自治。
若干年后如果将新疆甘肃宁夏合并为一个大区的话也很方便，这样就实现了中央（大区）——副省级地市州——县市——乡镇（半级政府，村居自治）的三级半治理模式，或者中央（大区）——州——市乡镇（村居自治模）的三级治理模式（市有原县城演变而来，乡镇可以适度合并）。
