西汉前,库尔勒市境为匈奴牧地,西汉时为西域三十六国之渠犁、尉犁、焉耆、乌垒国地,属西域都护府管辖,东汉其被焉耆国并,三国至隋时焉耆称臣于中原政权,受西域长史、戍己校尉等管辖,唐初属西突厥,公元648年(贞观二十二年)属焉耆都督府(隶安西都护府),宋属高昌回鹘及西辽,元属别失八里行尚书省,明属东察合台汗国。清初为准噶尔地,公元1759年(乾隆二十二年)清廷平定准噶尔大、小和卓木叛乱后属喀喇沙尔办事大臣下的库尔勒庄,设三品阿奇木伯克,公元1867(同治六年)中亚浩罕匪酋阿古柏军侵占库尔勒庄10年,公元1877年(光绪三年)清军收复此地,公元1882年(光绪八年)该地属喀喇沙尔直隶厅(今焉耆回族自治县),公元1898年(光绪二十五年)属焉耆府,1913年(民国二年)属焉耆县,1917年(民国六年)设库尔勒县佐,1920年(民国九年)属焉耆道,1928年(民国十七年)属焉耆行政区,1930年(民国十九年)成立库尔勒设治局,1939年(民国二十八年)库尔勒设治局升为库尔勒县,属焉耆行政区,1950年属焉耆专区,1954年撤焉耆专区改设库尔勒专区,1960年库尔勒专区并入新成立的巴音郭楞蒙古自治州,州治迁至库尔勒县,1979年库尔勒县成立库尔勒市,1983年撤库尔勒县并入库尔勒市。库尔勒市现辖属5个街道办事处2镇9乡。
库尔勒市在民国时有回、汉二城,回城在孔雀河南岸,城周四里,居民三百余户,当时的库尔勒县衙在回城,汉城则在孔雀河北岸,城周一里多,驻扎军队。今库尔勒市为巴音郭楞蒙古自治州首府,市境东、西长127公里,南、北宽105公里,行政区划面积7117平方公里,城市建成区面积45平方公里,人口近45万人,居住有23个民族,境内驻有新疆生产建设兵团农二师师部及所属3个农业团场、中国石油塔里木勘探开发指挥部、塔里木石化工程建设指挥部和乌鲁木齐铁路局库尔勒段等中央、自治区单位。