当地帕米尔土著占很少的一部分,大多数是塔吉克族,但是是伊斯马仪的什叶派穆斯林,和中国境内的塔吉克族一样.而塔吉克斯坦国内的穆斯林大多是逊尼派.
以下转自中文维基:
1890年以前,此地居民臣服于满清政府,此地划归新疆省管辖。19世纪后期英俄在亚洲争夺势力范围,因此1890年沙俄进驻并控制了包括此地在内的帕米尔高原北部地区。从满清到民国,中国政府始终坚持对此地拥有主权,不承认沙俄和苏联的占领合法,但是却无力进驻此地实行有效统治。
苏联时代州被划成戈尔诺—巴达赫尚自治区(Горно-Бадахшанская автономная область),自治区建于1925年。1929年塔吉克苏维埃社会主义共和国成立后,该区成为共和国的一部分。1950年代,戈尔诺—巴达赫尚自治区的大量土著居民帕米尔人被迫迁往塔吉克西南部。1991年塔吉克斯坦独立后,该区改名为“戈尔诺-巴达赫尚自治州”,当1992年塔吉克斯坦爆发内战时,自治州政府宣布独立。在内战期间,许多帕米尔人被其他族群杀害,该州也是反对派的大本营。后来自治州政府放弃了独立要求。1990年代,中华人民共和国政府和塔吉克斯坦签署边界条约,正式承认此地属于塔吉克斯坦所有。