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1946年1月29日，根据联合国最高司令官677号指令（SCAPIN-677），日本四大岛以外的区域，施政权被剥夺。
本文只讨论美国占领区。
冲绳县部分资料很多，在论坛也有很多人知道，这次先谈其他的地区。
旧金山和约签订前，归还：
伊豆诸岛
2个月后，1946年3月22日，归还日本。
吐噶喇列岛
该群岛北起口之岛，南到横当岛，1952年2月10日归还日本。美军政期间，和奄美群岛同属大岛支厅。
旧金山和约签订后，归还：
奄美群岛
由于美军政府大力经营冲绳本岛，忽视离岛。而奄美群岛距离日本本土较近，却因美军政府统治，而切断了和本土的交通，经贸联系。民众生活困顿，对美军统治日益不满，在奄美群岛本地出身的亲日学者昇曙梦的带领下，请愿回归日本。据称，14岁以上的岛民，99.8%的人支持请愿。更有人绝食抗议，中小学生写血书。
在这种背景下，1953年12月25日，奄美群岛回归日本，日本政府对美国表示感谢。
备注：1946年2月2日，驻日本的联军总司令部发表命令，将“鹿儿岛县大岛支厅”分离，成为无日本政府上级单位的“大岛支厅”。此后，又根据美国军政府的命令，将日本本土出身的“日本人”干部从公职中驱逐，强制遣返本土。而空缺的职务由奄美当地出身人担任。1946年10月成立临时北部琉球群岛政厅（日语：临时北部南西诸岛政庁。英语：Provisional Government of Northern Ryukyu Islands）。美军任命原大岛支厅长的丰岛至继续担任临时北部琉球询岛政厅知事。同时亦设置了作为咨询机关的“法制修改委员会”，后改为奄美民政议会。1950年11月，临时北部琉球群岛政厅改制为奄美群岛政府。
小笠原诸岛
小笠原是在日本投降前就部分被美军占领了，1945年9月3日美国军舰进入父岛，接受残余日军的投降，自此美国海军接管小笠原。
小笠原有一些西方血统的岛民，他们是19世纪30年代以来的英美渔民水手后裔。日本，英国，美国曾就该群岛主权有争议，直到1876年才确认日本主权，到1882年，岛上的欧美人全部归化日本籍。二战时，日本把这些欧美血统的日本人强制送到东京，后来又搬到了横须贺。战后，这些人推举领袖Fred Savory向美国领事请愿回岛。1946年3月19日，批准了欧美裔日本人和他们的配偶回到父岛，4月又有其他日本人请愿归岛，但是没有批准。
10月17日他们乘坐美军驱逐舰回岛，和美军住在一起。10月19日成立自治组织小笠原诸岛代表委员会（英语：Bonin island council，简称五人委员会）。
11月，美国国务院起草对日和平条约，建议伊豆诸岛非武装化，并对小笠原诸岛进行托管。1950年12月和日本交涉时，日本强烈反对。
最终双方妥协，美国承认日本的潜在主权，但日本认可行政，立法，司法权暂由美国掌握。
另一方面，1947年7月，非欧美裔的日本岛民成立了小笠原岛・硫黄岛归乡促进联盟，反复和日本，美国政府交涉。
然而，岛上的欧美裔日本人并不欢迎这些日本人回来。当地的美军长官也支持欧美裔日本人的诉求，同时还帮助这些欧美裔日本人取得美国国籍。
几经交涉，特别是出于冷战局势，拉拢日本对抗苏联和中国的考虑，美国最终同意归还日本。
1967年11月15日，日美缔结协定。1968年6月26日中午，正式由日本接管。
岛上的欧美裔居民又3年时间选择国籍。少部分人选择美籍，并移民美国。
行政体制，在归还日本之前，当地政府是小笠原诸岛美国军政府（United States Military Government of the Bonin islands），由驻在美海军司令兼任。他的上级是小笠原・马里亚纳诸岛军政府主任将校（Cheif Military Government officer Bonins-Marianas islands group）。
虽然承认日本潜在主权，但实际行政和美国在马里亚纳群岛的托管地是一体的。
